Kekurangan kritis benih berkualitas dari varietas produktif dan adaptif mungkin merupakan kendala utama produksi kentang di negara-negara Afrika Sub-Sahara. Hasil panen dan kualitas kentang yang dihasilkan bergantung pada kualitas benih kentang yang ditanam. Sebagian besar petani kecil di Afrika Sub-Sahara mendaur ulang benih kentang selama beberapa musim, yang mengakibatkan hasil panen rendah dan kualitas buruk karena degenerasi benih, yang disebabkan oleh penyakit yang ditularkan melalui benih. Diketahui juga bahwa banyak petani kecil menyimpan umbi kecil dari hasil panen mereka yang tidak dapat mereka jual sebagai benih, sehingga meningkatkan kemungkinan infeksi virus, termasuk virus yang sangat penting yang mengurangi hasil panen: virus penggulung daun kentang (potato leaf roll virus).PLRV) dan virus kentang Y (PVYYang lebih buruk lagi adalah ada petani yang menggunakan kentang konsumsi yang mereka beli dari sumber yang tidak dikenal sebagai bibit, sehingga meningkatkan kemungkinan tidak hanya penyebaran virus, tetapi juga penyebaran penyakit layu bakteri (BW) yang disebabkan oleh Ralstonia solancearum, di antara beberapa penyakit tular benih lainnya yang diketahui menurunkan hasil.

Menyadari tren yang sangat berbahaya ini, organisasi penelitian publik, petani komersial, LSM dan sektor swasta telah mendukung produksi benih berkualitas lebih baik melalui sistem benih formal, perantara (juga disebut alternatif) dan informal. Sistem benih formal, yang mengikuti prosedur produksi dan sertifikasi benih yang ketat, adalah cara yang paling pasti untuk menghasilkan benih berkualitas. Sertifikasi kentang benih yang paling ketat dilakukan di Kenya oleh Layanan Inspektorat Kesehatan Tanaman Kenya (KEPHIS). Namun, benih formal hanya mencakup kurang dari 5% kebutuhan benih kentang di sebagian besar negara sukses seperti Kenya, dan tetap kurang dari 3% di sebagian besar negara SSA. Sistem ini menghasilkan benih yang mahal sehingga petani tidak dapat membelinya dengan mudah, dan produksi terbatas hanya di beberapa lokasi sehingga meningkatkan biaya transportasi untuk sampai ke petani. Ini ditambah dengan jumlah kecil yang dihasilkannya tidak membuatnya menjadi pemecah masalah yang efektif tetapi menjadi dasar untuk sistem selanjutnya. Sistem alternatif atau perantara memiliki komponen formal dan informal dan diproduksi lebih dekat dengan petani. Sistem ini sebagian besar mengikuti sistem produksi benih yang dinyatakan berkualitas (QDS) mengikuti kriteria tertentu, yang dapat bervariasi antar negara. Di Etiopia, meskipun tidak seketat formal dalam hal infeksi dan kemurnian virus, kentang tidak memiliki toleransi terhadap BW, karena ini adalah penyakit kentang yang paling merusak di negara tersebut. Kenya juga tidak memiliki toleransi terhadap BW. Benih jenis ini diproduksi oleh petani komersial terlatih, koperasi dan beberapa petani kecil yang maju. Produsen ini mendapatkan benih dasar dari pusat penelitian (sistem formal) dan selanjutnya benih massal untuk mendapatkan jumlah di bawah peraturan QDS. Benih yang mereka hasilkan diperiksa oleh pengawas pemerintah, misalnya, di Etiopia baik di lapangan maupun di toko (diffused light store, DLS). Benih ini dapat terinfeksi BW dalam proses produksi QDS jika tanahnya penuh dengan bakteri. Sayangnya, hal ini tidak mudah dideteksi oleh inspektur karena mereka hanya melakukan inspeksi visual.

Untuk menerapkan sistem produksi benih berkualitas tinggi guna meningkatkan kinerja ketiga sistem yang dibahas di atas, ketersediaan benih kentang generasi awal yang bersih merupakan prasyarat. Sebagian besar negara di SSA, antara lain, Burundi, Ethiopia, Kenya, Malawi, Rwanda, Tanzania, dan Uganda memiliki infrastruktur dasar, termasuk laboratorium kultur jaringan, aeroponik, dan rumah kasa di mana minituber bersih diproduksi dari planlet in-vitro. Di beberapa negara ini, unit aeroponik belum dimanfaatkan secara efisien karena pemadaman listrik dan kelangkaan nutrisi. Selain itu, jelas untuk dicatat bahwa ada kemungkinan penyebaran BW dengan benih generasi awal karena pengujian BW pada setiap tahap produksi benih generasi awal mulai dari umbi mini tidak dilaksanakan secara ketat. Beberapa penelitian menunjukkan bahwa BW telah disebarluaskan ke daerah dataran tinggi non-tradisional dengan perpindahan benih mungkin dari pusat penelitian.

Terlepas dari semua ini, beberapa tren dalam kaitannya dengan produksi benih berkualitas cukup menggembirakan, misalnya, pertanian Kisima menghasilkan sekitar 200 ha benih kentang per tahun yang secara resmi bersertifikat bersih. Di Etiopia, banyak koperasi dan beberapa petani komersial juga menghasilkan QDS yang memiliki kualitas yang dapat diterima, yang merupakan langkah ke arah yang benar. Dukungan apa pun yang diberikan untuk produksi benih berkualitas untuk dijual ke produsen kentang di SSA akan berkontribusi pada transformasi industri kentang, memungkinkannya untuk berkontribusi secara signifikan terhadap ketahanan pangan dan pendapatan rumah tangga dan ekonomi makro masing-masing negara.

Peternakan Kisima adalah produsen bibit kentang bersertifikat terbesar di Kenya, memasok sekitar 75% dari total bibit kentang bersertifikat yang tersedia di negara tersebut. Perusahaan ini memproduksi bibit kentang untuk varietas pilihan petani, yang sebagian besar adalah KALRO/CIP dibiakkan dan beberapa HZPC Varietas kentang dikembangkan berdasarkan permintaan. Setiap tahunnya, perusahaan ini memproduksi lebih dari 4000 MT kentang, di mana 75% di antaranya memenuhi syarat sebagai bibit dengan ukuran umbi 28-45 mm (ukuran 1), dan 45-60 mm (ukuran 2). Untuk memastikan bibit kentang yang diproduksinya bersih, perusahaan memulai dari bibit in-vitro yang diperoleh dari GTIL dan Stokmen Rozen dan menanamnya secara aeroponik untuk menghasilkan umbi mini yang kemudian diperbanyak dalam jumlah besar di tanah yang bersih.

Banyak pengganda benih skala kecil baik secara individu maupun kelompok telah mulai menanam benih berkualitas dari benih bersertifikat yang mereka beli dari kebun Kisima, yang mereka jual ke petani kentang lainnya. Para petani ini telah menghasilkan banyak uang karena hasil panen mereka meningkat sekitar 60%, yang mengakibatkan peningkatan pendapatan rumah tangga yang sesuai. Petani tidak selalu harus melakukan perjalanan jauh ke Kisima untuk mendapatkan benih berkualitas karena produsen benih skala kecil seperti itu menyediakannya di dekat mereka.